Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP36Q9P275 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms