Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MBD5Q9P267 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MBD5Q9P267 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MBD5Q9P267 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms