Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ABRACLQ9P1F3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRACLQ9P1F3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms