Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD3Q9P035 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms