Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD2Q9NZN4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms