Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYOFQ9NZM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYOFQ9NZM1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms