Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSD3Q9NYI0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSD3Q9NYI0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms