Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms