Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf109Q9NX04 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf109Q9NX04 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf109Q9NX04 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf109Q9NX04 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf109Q9NX04 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf109Q9NX04 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf109Q9NX04 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf109Q9NX04 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms