Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR3EQ9NVU0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR3EQ9NVU0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR3EQ9NVU0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms