Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TCP11L1Q9NUJ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP11L1Q9NUJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms