Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMSN1Q9NSI8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMSN1Q9NSI8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms