Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC13Q9NSE7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC13Q9NSE7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms