Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCND1Q9NSA2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCND1Q9NSA2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCND1Q9NSA2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms