Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDLIM7Q9NR12 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDLIM7Q9NR12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM7Q9NR12 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM7Q9NR12 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM7Q9NR12 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM7Q9NR12 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM7Q9NR12 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM7Q9NR12 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDLIM7Q9NR12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDLIM7Q9NR12 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDLIM7Q9NR12 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDLIM7Q9NR12 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms