Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSCN3Q9NQT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN3Q9NQT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms