Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR9

GPR108, Protein GPR108, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR108Q9NPR9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GPR108Q9NPR9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPR108Q9NPR9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms