Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCFQ9NPI8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCFQ9NPI8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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