Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCNB1IP1Q9NPC3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms