Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARD6AQ9NPB6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms