Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CABP2Q9NPB3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CABP2Q9NPB3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CABP2Q9NPB3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CABP2Q9NPB3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CABP2Q9NPB3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CABP2Q9NPB3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CABP2Q9NPB3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CABP2Q9NPB3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CABP2Q9NPB3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CABP2Q9NPB3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CABP2Q9NPB3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CABP2Q9NPB3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms