Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSU72Q9NP77 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms