Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC4Q9NNZ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC4Q9NNZ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms