Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
EPB41L4AQ9HCS5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPB41L4AQ9HCS5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms