Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX8Q9HC52 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX8Q9HC52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX8Q9HC52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms