Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3GQ9HC16 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms