Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LGR6Q9HBX8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LGR6Q9HBX8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LGR6Q9HBX8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms