Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPV4Q9HBA0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPV4Q9HBA0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPV4Q9HBA0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms