Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC52A2Q9HAB3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC52A2Q9HAB3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms