Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ELP3Q9H9T3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ELP3Q9H9T3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ELP3Q9H9T3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms