Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C10orf88Q9H8K7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C10orf88Q9H8K7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms