Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRDE2Q9H7Z3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRDE2Q9H7Z3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms