Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUDS3Q9H7L9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUDS3Q9H7L9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms