Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP3Q9H6T3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP3Q9H6T3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms