Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms