Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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