Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms