Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms