Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIOK2Q9BVS4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIOK2Q9BVS4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms