Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB2BQ9BVA1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB2BQ9BVA1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms