Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf50Q9BV19 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf50Q9BV19 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms