Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRAF4Q9BUZ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF4Q9BUZ4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms