Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf16Q9BUW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf16Q9BUW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms