Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RSRP1Q9BUV0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RSRP1Q9BUV0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms