Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB6Q9BUF5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms