Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV5

FSD1, Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSD1Q9BTV5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSD1Q9BTV5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSD1Q9BTV5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSD1Q9BTV5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms