Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN3Q9BTN0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN3Q9BTN0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms