Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAGR1Q9BTK6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PAGR1Q9BTK6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAGR1Q9BTK6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms