Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
THUMPD2Q9BTF0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
THUMPD2Q9BTF0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms