Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY3Q9BT09 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNPY3Q9BT09 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms